Река Чуя - самый крупный приток Катуни. Длина реки 320 километров, в пределах Чуйской степи она имеет спокойное течение, а затем, стесненная Курайским, Северо-Чуйским хребтами и хребтом Сальджар, превращается в бурный поток. После впадения реки Машей Чуя пробивает в скалах узкое ущелье, известное как Мажойский прорыв.
Вдоль Чуи проходит основная транспортная артерия Горного Алтая - Чуйский тракт.