Территория "Лебединого" заказника характеризуется богатым видовым разнообразием ее обитателей. Совокупность уникальных водоемов и положение заказника на левом берегу Катуни, в предгорьях Алтая, создают благоприятные условия для концентрации и отдыха перелетных птиц. Здесь обитают 35 видов животных, занесенных в Красную книгу Алтайского края